
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱微生物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科研数据
科学研究成员探求逐渐冷冻冷藏箱期限不断加强了鸡肉的硬性、持反击式水轮机、油润度、徘徊铁分子量、ROS、脂质过非金属氧化物物、MDA、GSH和GPX4性能来评价指标腿部肌肉结构神经元的铁死的情形。报告凸显,冷冻冷藏箱期限不断加强了后,鸡肉的硬性在第8天和第6天正相关的影响;持水性能影响;背景颜色变深,损失油润,鲜大灰色改成暗大灰色。因此,徘徊铁、特异性氧和MDA的分子量正相关加强,神经元凋亡率正相关提高。 研究进行解析人员管理分离出来与众其他保鲜准确时间的肌群样本的核蛋清酶质,进而做出SDS-PAGE进行解析,核蛋清酶质条带在与众其他年间分布点均衡且相近(图1a)。基于核蛋清酶在与众其他样本中的展示时候,进行解析显示相同组样本的中个数类似于相同总体水平(图1b),表示肌群样本核蛋清酶质拥有优秀的组内相近性和组间对比分析性。 球膳食纤维组学共签别出1996种球膳食纤维。以B0为比组,淘汰B1、B2、B4和B6中的球球淀粉酶开展性别文化差异表明分折,共签别到375个DEPs。将火山图可视化管理,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位规范标准分折DEP。结局如同1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别签别出22、33、73和140个DEPs,之中别上涨6、11、32和8七个,下降16、22、41和58个。聚类分析法最简单的方法测评了不同于冷库一阶段腿部肩部肌肉组织机构中球膳食纤维的表明,结局呈现腿部肩部肌肉球球淀粉酶表明性别文化差异如今会自动储存的时间的增长而增长(图1g)。
图1| 不同的冷藏箱周期的健身肌肉样板淀粉酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所区别冷藏箱时候的健身肌肉样品英文区别蛋白质了解(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白酶肽的PRM定量阐述阐述(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 由于KEGG聚集差异化表明蛋白酶的铁死亡者长效机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物学提供了TMT降钙素原检测球核蛋白组学新技术水平咨询管理,拜谱海洋生物已新护肤品开发完整并建立起了进一步完善早熟的转录组学、球核蛋白组学、代谢率组学或者多个学联办护肤品新技术水平咨询管理指标体系,欢迎致电咨询!
决定性论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.